bup - backup system based on git

Very efficient backup system based on the git packfile format, providing fast incremental saves and global deduplication (among and within files, including virtual machine images).

https://github.com/bup/bup

В центоси легче всего поставить так:
1) либы
yum install python python-devel
yum install fuse-python pyxattr pylibacl
yum install perl-Time-HiRes

2) скачать сам пакет
http://dl.fedoraproject.org/pub/fedora/linux/releases/26/Everything/x86_64/os/Packages/b/bup-0.29-2.fc26.x86_64.rpm

3) rpm -Uvh bup*

4) используем.
Initialize the default BUP_DIR (~/.bup):
 bup init

Make a local backup (-v or -vv will increase the verbosity):
 bup index /etc
 bup save -n local-etc /etc

Restore a local backup to ./dest:
 bup restore -C ./dest local-etc/latest/etc
 ls -l dest/etc

Для пропуска некоторых файлов у index есть опции
--exclude
--exclude-from

Чтобы указать рабочий каталог отличный от ~/.bup, можно сделать так
export BUP_DIR=/backup/bup/...